原為牟平縣第六區(qū)、第八區(qū)轄地。

1941年，隸屬牟海行政公署第六區(qū)。

1942年，改為第十區(qū)。

1945年，名崖子區(qū)。

同年，西部馬石店等23村化為歸牙前縣，設馬石區(qū)。

1950年7月，復稱第十區(qū)。

1951年，區(qū)下設10鄉(xiāng)。

同年，第十五區(qū)5鄉(xiāng)并入。

1955年9月，復稱崖子區(qū)。

1956年，原15鄉(xiāng)合并為崖子、崮頭、鳳凰崖、北果子四鄉(xiāng)。

1957年7月，撤區(qū)，4鄉(xiāng)直接屬縣。

1958年7月-9月，崮頭，鳳凰崖、北果子3鄉(xiāng)相繼并入崖子鄉(xiāng)，成立崖子人民公社，12月，乳山縣建制撤銷，劃歸煙臺市。

1960年3月，改屬牟平縣。

1961年10月，重設乳山縣后，復歸乳山縣。

1969年7月，析17村置馬石店人民公社。

1984年3月，置崖子鎮(zhèn)。

2001年5月將馬石店鎮(zhèn)撤銷，并入崖子鎮(zhèn)至今。