因管轄區(qū)域得名，2003年民政部批準玉門市政府搬遷至玉門鎮(zhèn)，稱為玉門新市區(qū)。

玉門鎮(zhèn)因清代于此置玉門縣而得名。

赤金鎮(zhèn)因史載“金山在其東，出金”；“金”“斤諧音，色赤，故為赤金。

花海鎮(zhèn)古為延興海，有花海子；又說地有紅柳，密而壯觀，謂之花海。

老君廟鎮(zhèn)因境內老君廟而得名。

清雍正三年（1725年），黃閘灣鎮(zhèn)因瓜州、玉門及兵屯之地時發(fā)旱災，勒河每夏缺水，常引被斗，于此置閘分水，爭水之事遂平，人稱皇閘，后取諧音名黃閘灣。

下西號鎮(zhèn)因清置屯田，立號為界，以位定名，謂下西號。

柳河鎮(zhèn)因疏勒河支流穿鄉(xiāng)而過，古為柳溝地，又毛柳繁密叢生，取名柳河。

相傳薛仁貴西征在此牧馬，立名昌馬。

柳湖鎮(zhèn)為安置移民而立的新鄉(xiāng)，地有紅柳，密而壯觀。玉門鄉(xiāng)鎮(zhèn)名稱已有泉、河、海者，獨無湖字，故曰柳湖，以成“泉河湖�！饼R全之意。

此地歷史上有漢代的六座烽燧，整個區(qū)域被當?shù)厝朔Q為六墩灘，因此地有烽燧六墩故名。

因地處花海鎮(zhèn)金灣村以漲，得名小金灣。

獨山子東鄉(xiāng)族鄉(xiāng)境內有獨山子，總人口以東鄉(xiāng)族為主，因此得名。