長寧村建國初屬漢壽縣六區(qū)；1955年，劃歸南縣三區(qū)長寧鄉(xiāng)；1956年，設(shè)立三岔河鄉(xiāng)，為三岔河長寧高級農(nóng)業(yè)社；1961年，體制調(diào)整，三岔河公社從樂新公社析出，設(shè)立三岔河鄉(xiāng)三岔河、長寧大隊；1984年，政社分設(shè)，為三岔河鄉(xiāng)三岔河村、長寧村；1985年三岔河鄉(xiāng)并入茅草街鎮(zhèn)，為茅草街鎮(zhèn)三岔河村、長寧村；1992年，茅草街鎮(zhèn)析出三岔河農(nóng)工商總公司，為三岔河農(nóng)工商總公司三岔河村、長寧村；1994年，三岔河農(nóng)工商總公司改為三岔河鄉(xiāng)，為三岔河鄉(xiāng)三岔河村、長寧村；2005年，綜合改革，三岔河鄉(xiāng)并入茅草街鎮(zhèn)，為茅草街鎮(zhèn)三岔河村、長寧村；2016年，行政區(qū)劃調(diào)整，三岔河村、長寧村合并為三寧河村。