棗科村民國時期隸屬濮縣（今濮城鎮(zhèn)駐地）管轄。

1927年—1947年土改時期到1949年新中國成立，隸屬濮縣、尚和縣。

1950年—1956年初級社時，撤尚和、濮縣劃歸濮陽縣四區(qū)管轄。

先后歸化莊、這河寨小鄉(xiāng)管理。

1957年—1959年歸戶部寨鄉(xiāng)人民公社管轄，后因下大雨金堤南水勢大，去戶部寨鄉(xiāng)交通不便，劃歸到柳屯人民公社管轄。

1965年—1969年，棗科村與土嶺頭村合并，更名為紅衛(wèi)大隊。

1970年與土嶺頭村分開，恢復(fù)棗科大隊。

1982年地名普查更名為棗科管委會。

1983年取消人民公社建立鄉(xiāng)鎮(zhèn)政府，將棗科管委會更名為棗科村村民委員會。