清代西部屬唐縣長秋保（今長秋村），北部屬唐河保（今張店鎮(zhèn)馬店村），南部屬黃臺保（今黑龍鎮(zhèn)謝莊村委黃臺寺舊址）。

1914年屬沘源縣。

1923年屬唐河縣城關(guān)區(qū)。

1931年設(shè)上屯區(qū)。

1941年屬城關(guān)區(qū)上屯聯(lián)保。

1945年撤區(qū)建上屯鄉(xiāng)。

1948年屬唐南縣第七區(qū)。

1949年屬唐河縣郭灘區(qū)、昝崗區(qū)。

1956年撤區(qū)，分別屬上屯、長秋、黑龍鎮(zhèn)3個(gè)中心鄉(xiāng)。

1958年成立上屯公社。

1961年設(shè)上屯區(qū)。

1968年撤區(qū)重設(shè)上屯公社。

1983年改為上屯鄉(xiāng)。

1999年撤鄉(xiāng)上屯鎮(zhèn)至今。