相傳距現(xiàn)木孔街2公里的坪上，有一棵千年無(wú)名古樹(shù)，參天聳立，古樹(shù)徑大心空，非常奇特，樹(shù)肚內(nèi)能擺放一張大方桌和四根板凳供人們棋牌娛樂(lè)，樹(shù)木古老“空”為“孔”，因此而得名“老木孔”。

明清時(shí)，此地又名“臨江場(chǎng)”，是烏江支流偏巖河畔的一個(gè)渡口。

1949年，置木孔鄉(xiāng)，因治所地在老木孔街上，去掉“老”字，取名“木孔”。

1953年，木孔鄉(xiāng)析設(shè)木孔鄉(xiāng)和灣子鄉(xiāng)。

1958年，實(shí)行人民公社制度，同時(shí)撤銷(xiāo)木孔鄉(xiāng)和灣子鄉(xiāng)，分別并入安底公社和沙土公社。

1962年，析建木孔公社、灣子公社。

1984年，木孔公社、灣子公社分別改為木孔鄉(xiāng)、灣子鄉(xiāng)。

1992年，撤銷(xiāo)沙土區(qū)的灣子鄉(xiāng)、安底區(qū)的木孔鄉(xiāng)，合并新建為木孔鄉(xiāng)。

2016年1月29日，貴州省人民政府批復(fù)同意撤銷(xiāo)木孔鄉(xiāng)建制，設(shè)置木孔鎮(zhèn)。

撤鄉(xiāng)設(shè)鎮(zhèn)后行政區(qū)域和政府駐地不變。