南宋祥興元年（1278年），末帝趙昺為逃避元兵追趕登基硇洲，曾升硇洲鎮(zhèn)為翔龍縣。

元朝初期，復歸吳川縣管理。

清光緒二十五年（1899年），法國強租廣州灣，硇洲島淪為法國殖民地。

民國三十一年（1942年），日本侵占廣州灣，曾一度為日本所占據(jù)。

民國三十四年（1945年）8月15日，日本投降后，中國收回廣州灣改名為湛江市，硇洲鎮(zhèn)歸湛江市管轄。

民國三十七年（1948年）8月2日，設東硇特區(qū)。

1949年11月19日，湛江市解放，硇洲島由湛江市軍管會管轄。

1950年5月，設立硇洲區(qū)人民政府。

1952年2月，劃歸雷東縣。

1958年7月，撤銷雷東縣，劃歸湛江市郊區(qū)。

1958年10月9日，設立硇洲公社。

1968年7月3日，改為硇洲革命委員會。

1973年2月8日，恢復硇洲公社。

1983年3月2日，設硇洲區(qū)公所。

1987年5月2日，改制為湛江市麻章區(qū)硇洲鎮(zhèn)。