元代時(shí)期，祁連鎮(zhèn)境域?yàn)槲鳑龈牎?/p>
明正統(tǒng)三年（1438年），為古浪守御千戶(hù)所轄。
清代時(shí)期，由涼州衛(wèi)管轄。
清雍正時(shí)期，屬武威縣。
1950年5月，為天祝自治區(qū)第五分鄉(xiāng)。
1956年12月，武威縣南山鄉(xiāng)并入。
1958年12月，設(shè)祁連公社。
1959年2月，劃給肅南縣；同年8月，又劃歸天�？h。
1971年12月，劃入武威縣。
1981年12月，又劃歸天�？h。
1983年5月，撤銷(xiāo)公社，設(shè)天山、錄述鄉(xiāng)，屬祁連區(qū)。
1985年10月，撤區(qū)并鄉(xiāng)，為祁連鄉(xiāng)。
2018年3月，祁連鄉(xiāng)撤鄉(xiāng)建鎮(zhèn)。