南唐李暻中興元年（958），升永安場為建寧縣，始命名為水南，沿革至今。

民國時(shí)期設(shè)水南保。

中央蘇區(qū)時(shí)期其間，1931年6月成立水南鄉(xiāng)革命委員會(huì)，1932年11月經(jīng)選舉產(chǎn)生“水南鄉(xiāng)蘇維埃政府”。

1950年2月11日成立水南村委員會(huì)，1951年2月成立水南鄉(xiāng)人民政府，1956年8月成立水南鄉(xiāng)人民委員會(huì)，1958年成立溪口人民公社水南大隊(duì)，1960年成立建寧綜合農(nóng)場鄒家耕作管理委員會(huì)，不久更名為水南耕作區(qū)，1968年11月12日成立建寧縣綜合農(nóng)場水南耕作區(qū)革命領(lǐng)導(dǎo)小組，1970年12月，改為城關(guān)公社水南大隊(duì)革命領(lǐng)導(dǎo)小組，1976年12月，綜合農(nóng)場恢復(fù)建制，1977年1月成立綜合農(nóng)場水南管理區(qū)，1981年，始改稱國營建寧縣綜合農(nóng)場水南大隊(duì)管委會(huì)。

1991年5月19日成立建寧縣綜合農(nóng)場水南村委員會(huì)，2007年10月屬濉溪鎮(zhèn)水南村村民委員會(huì)。